在刑事案件中，如果同案犯的口供不一致，法院在判决时会采取以下措施：
综合考虑其他证据：
法院不会仅凭口供来定罪，而是需要综合考虑所有相关证据。即使口供存在不一致，只要其他证据确实、充分，并且符合法定程序，法院仍然可以认定被告人有罪并处以刑罚。
审查口供的合法性和客观性：
在庭审过程中，法官会对每份口供的合法性、客观性及其与其他证据的相关性进行深入分析。如果发现口供之间存在矛盾，法官会结合其他类型的证据，如实物证据、书面材料、已证实的证词、专家评估报告等，来衡量这些口供的可靠性。
排除合理怀疑：
法院在定罪时必须排除所有合理怀疑，确保所依据的证据确实、充分。如果证据不足以支持某一口供，或者存在其他合理的解释，法院可能会对口供的真实性产生怀疑，并据此作出不同的判决。
伪证罪的追究：
如果口供前后不一致是由于证人故意作虚假证明而意图陷害他人或隐匿罪证，该证人可能会构成伪证罪，并受到相应的法律制裁，包括三年以下有期徒刑或拘役，情节严重者可能会被判处三年以上七年以下有期徒刑。
综上所述，同案口供不一致并不会直接影响判决结果，法院会依据具体情况和所有相关证据来做出公正合理的裁决。关键在于确保证据的确实性、充分性，并严格遵循法定程序进行审判。