公司要求上交毕业证原件的原因主要有以下几点：
验证学历真实性：
毕业证是证明个人所获得学历的重要文件，公司需要核实申请人的学历信息是否真实有效。通过查看原件，可以确保申请人提供的学历信息与实际情况一致。
遵循法律法规：
一些行业或职位有特定的学历要求，公司需要确保员工具备相应的学历背景，以满足法律法规的要求。
提供给相关机构或合作伙伴：
公司需要向政府部门、合作伙伴或客户提供员工的学历证明。上交毕业证原件可以简化证明程序，提高效率。同时，内部档案管理也需要将员工的学历信息纳入系统，以便进行人力资源管理和发展规划。
甄别证件真假：
由于现在假的证件较多，特别是复印件造假较难识别，因此使用原件可以更好地甄别证件的真伪。
审核求职者的登记信息：
公司在入职时要求提交毕业证原件，是为了审核求职者在登记信息中所填的毕业院校和学历的真假，确保招聘标准的执行。
保护学历不被冒用：
要求提供毕业证原件还可以防止有人冒用你的毕业证去应聘，从而保护你的学历不被冒用。
综上所述，公司要求上交毕业证原件主要是为了验证学历的真实性、遵循法律法规、方便提供给相关机构、甄别证件真假、审核求职者的登记信息以及保护学历不被冒用。