北京企业摇号办理流程如下：
登录网站
企业需要登录北京市机动车摇号官方网站，并填写相关信息。这些信息包括公司基本信息、公司组织机构信息、公司纳税信息和上一年度纳税额等。
资格确认
登录北京小客车指标调控管理信息系统网站，点击首页的“资格确认”，进入资格确认页面后选择申请人所在区，然后点击“下一步”。按照要求填写个人和单位信息，提交时不需要再次修改。如果个人信息有错误，可以自行修改；如果是单位的其他人员，则需要由该单位的法定代表人或者其授权委托人签字、加盖公章。
提交书面审核材料
申请人携带相关材料到各区对外办公窗口提交书面审核材料。审核通过后由各区分中心将申请人信息报市交管局。
等待审核
审核时间一般会在5个工作日内完成，届时系统会提示是否通过审核。如果未通过，则不能进行下一步的操作。
查询配售结果
每月26日起，申请人可通过互联网查询配售结果和确认登记时间安排。逾期未确认的视为自动放弃，重新参与普通燃油车摇号和竞拍。
签署承诺书
自2020年1月1日起，参加普通燃油车竞价、竞拍的申请人需持有效身份证件原件现场签署《自愿退出限购承诺书》，方可参加普通燃油车上牌。
提交必要资料
在申请过程中，企业需要准备一些必要的申请资料，包括统一社会信用代码的营业执照或有效登记证书、法人身份证明以及委托手续和小客车过户（或转出、注销）证明等。其中，“委托手续”是指单位盖章的授权委托书，要求写明受托人的姓名及身份证件号码，并明确委托事项；受托人需要提供有效身份证件。
建议：
企业在申请摇号前，应仔细核对所有资料是否准确无误，并按照规定的流程进行操作。如有疑问，可以咨询相关部门或专业人士以获取帮助。